Методе (Април 2020)

Брза и тачна корекција грешака ампликанових пироактивних последица помоћу Акација

Брза и тачна корекција грешака ампликанових пироактивних последица помоћу Акација

Субјекти Биоинформатика Микробне заједнице Секвенцирање Уреднику: Методе микробне разноликости засноване на секвенцирању ампликона високе пропусности компромитиране су грешкама у читању. Роцхе 454 ГС ФЛКС Титанијум пиросекционирање је тренутно најчешће коришћена технологија за студије микробне заједнице засноване на ампликону, упркос високим стопам

Квантификација локалне резолуције крио-ЕМ мапа густине

Квантификација локалне резолуције крио-ЕМ мапа густине

Субјекти Криоелектронска микроскопија Обрађиванње слике Протеини Софтвер Апстрактан Предлажемо дефиницију локалне резолуције за тродимензионалне електронске крио-микроскопске мапе (крио-ЕМ) густине које користе локалне синусоидне карактеристике. Наш алгоритам нема слободних параметара и применљив је на остале модалитете снимања, укључујући томографију. Процјењујући локалну резолуцију реконструкције једноструких честица и просјека субтомограма за четири прим

Визуализација података: двосмисленост као сувозача

Визуализација података: двосмисленост као сувозача

Субјекти Биоинформатика Рачунарска биологија и биоинформатика Бити сигуран да је добро; бити несигуран није нужно лоше. Истраживачки тимови раде на визуелном представљању неизвесности. Главни Подаци из експеримента могу изгледати чврсто. Након даљњег испитивања, подаци могу прећи у нешто много чвршће. Реакција колена на ову загонетку може б

ПротеомеБиндерс: планирање европског ресурса афинитета за анализу људског протеома

ПротеомеБиндерс: планирање европског ресурса афинитета за анализу људског протеома

Исправљање овог чланка објављено је 01. фебруара 2007 Овај чланак је ажуриран ПротеомеБиндерс је нови европски конзорцијум који има за циљ да успостави свеобухватан ресурс добро окарактерисаних афинитетних реагенса, укључујући, али не ограничавајући се на антитела, за анализу људског протеома. С обзиром на огромну разноликост протеома, обим пројекта је потенцијално огроман, али ипак изводљив у контексту паневропске или чак светске координације. НАПОМЕНА: У верзији првобитно објављеног чланка име Манфреда Коегла погрешно је написано

Додатак: Истраживање детерминанти секвенци амилоидне структуре користећи матрике бодовања специфичних за положај

Додатак: Истраживање детерминанти секвенци амилоидне структуре користећи матрике бодовања специфичних за положај

Субјекти Агрегација протеина Секвенце протеина Протеоме информатика Оригинални чланак објављен је 14. фебруара 2010 Нат. Методе 7 , 237–242 (2010); објављено на мрежи 14 фебруара 2010; додатак објављен после штампања 29. септембра 2010. Након објављивања нашег рада открили смо грешку у Табели 1 која се односи на поређење нашег програма, Валтза, са 3Д профилом програма 1 (реф

Плазмиди: куповина у доба обиља

Плазмиди: куповина у доба обиља

Субјекти Цитолошке технике Функционална геномика Соларне ћелије Технологија Управљање, дељење и контрола квалитета плазмида може бити једноставно. Али многе технике за њихово ширење не повећавају се, што води непрофитним организацијама и компанијама да истражују нове опције. Главни Постоји много начина да се „купује“ за плазмиде, екстрахромосомску, кружну ДНК која се налази у бактеријама и неким еукариотским ћелијама. Плазмиди прихватају и лако реплицирају исјечке стране ДНК, што их чини свестраним вектор

Што је мање, то је боље

Што је мање, то је боље

Биолози су све више заинтересирани за једно-молекуларне приступе. У овом издању, Фоцус пружа биолошком водичу за ово релативно ново поље, а два рада представљају напредак у наноскалијској визуализацији. Посетите метхагора да бисте видели и објавили коментаре на овај чланак. Способност анализе биолошких система на нивоу једно-молекула отвара путеве истраживања који нису

Исправљање: Тачна идентификација варијанти са једним нуклеотидом у појединачним ћелијама амплифираним целим геномом

Исправљање: Тачна идентификација варијанти са једним нуклеотидом у појединачним ћелијама амплифираним целим геномом

Оригинални чланак објављен је 20. марта 2017 Нат. Методе 14 , 491–493 (2017); објављено на мрежи 20. марта 2017; исправљено након штампања 13. октобра 2017 У верзији овог чланка који је првобитно објављен, Лодато, МА и др . Сциенце 350 , 94–98 (2015) (референца 2) наведен је као пример истраживања једноћелијских секвенцирања са високим прелазима ЦГ у ТА која примењ

Производи Тхермо Сциентифиц омогућују примену врхунских матичних ћелија

Производи Тхермо Сциентифиц омогућују примену врхунских матичних ћелија

Апстрактан Портфолио Тхермо Сциентифиц Стем Целл Екцелленце обухвата многе производе неопходне за успешно истраживање матичних ћелија. Употребљени од стране истраживача за подршку врхунским апликацијама у лабораторијама широм света, производи у портфолиу Стем Целл Екцелленце пружају тачност и поузданост која су потребна за подршку овом револуционарном истраживачком подручју. Овде смо описали примену неколико ових производа у истраживању матичних ћелија за биоинжињеринг. Главни Сви Тхермо Сциентифиц производи у портфељу Стем Целл Екцелленце дизајнирани су тако да омогуће најбоље услове за узорке

Микроскопија: преглед кроз ткиво

Микроскопија: преглед кроз ткиво

Субјекти Ћелијска неурознаност Флуоресцентно снимање Технологија Узорци ткива распршују светлост и искључују дубљи поглед. Средства за чишћење ткива су то променила, али научници морају размотрити оптимизацију оптике приликом употребе ових метода. Главни Да би проучио узроке срчаних удара, немачки анатом Вернер Спалтехолз развио је начин да срце постане ткиво провидно мешавином бензил алкохола и метил салицилата. На изложби 1911. године изложио је 370 свој

Исправка: Масовно паралелна мутагенеза са једном аминокиселином

Исправка: Масовно паралелна мутагенеза са једном аминокиселином

Оригинални чланак објављен је 05. јануара 2015. године Нат. Методе 12 , 203–206 (2015); објављено на мрежи 5. јануара 2015; исправљено након штампања 10. априла 2017 У верзији овог чланка која је првобитно објављена, јединица (нМ) за концентрацију дУТП-а описана у одељку „Припрема шаблона за дивљи тип“ у Интернет методама није била тачна. Исправна јединица треба да буде µМ. Грешка је исправљена у ХТМЛ и ПДФ верзији чланка од 10. априла 2017. Аутори Потражите Јацоб О Китзман у: Часописи за истраживање природе • ПубМед • Гоогле зналца Потражите Леа М Старита у: Часописи за истражив

Интелигентно дизајниран одговор

Интелигентно дизајниран одговор

Све је вероватније да ће научници бити позвани да разговарају о миту о интелигентном дизајну као научној теорији. Посетите метхагора да бисте видели и објавили коментаре на овај чланак. Нешто више од годину дана пре него што прославимо стогодишњицу Дарвиновог рођења, анти-дарвински активизам је жив и здрав. Најзлогласнији покрет промовиш

Мицрофлуидицс: у потрази за апликацијом убице

Мицрофлуидицс: у потрази за апликацијом убице

Компаније и академски истраживачи развијају све више микрофлуидних уређаја. Али оно што технолошки заинтересовани заиста желе је апликација која ће покренути широко усвајање микрофлуидике од стране биолога. Натхан Блов извјештава. Поље микрофлуидика је сада на месту где је покренута потрага за „апликацијом за убице“ - или „апликацијом за убице“, како би рекли компјутерски људи. То

Мале РНК: нови храбри биолошки свет

Мале РНК: нови храбри биолошки свет

Мали напори на откривању и профилирању РНК драматично преобликују основне концепте регулације гена и воде до нових алата за проучавање функција гена. Способност дволанчане РНК да утиша гене први пут је описана у Цаенорхабдитис елеганс 1998. - откриће које би Андрев Фире и Цраиг Мелло заслужило за Нобелову награду за физиологију или медицину 2006. године. Наше знање о ћелијском малом РНА свету и његовој способности да регулише гене при

Бушење у великим подацима о геному рака

Бушење у великим подацима о геному рака

Субјекти Биоинформатика Геномика рака Асфалтирање путева кроз планине података, конзорцијуми развијају радне токове и алате за широку употребу. Главни Генетичар рака Маттхев Меиерсон, који је на Институту за рак Дана-Фарбер и на широком институту МИТ и на Харварду, прати много начина на који тумори стварају хаос у уредним ћелијама. Жели да у свој распоред угура намјенски временски период у лабораторији Гада Гетза на Широком институту, како би искренуо своје рачунске вјештине за анализу података о генима карцинома. Оваква сарадња би могла постати уобичајенија када научници зароне у скупове подат

Брза, високопропусна припрема библиотеке за секвенцирање нове генерације

Брза, високопропусна припрема библиотеке за секвенцирање нове генерације

Субјекти Хемијске библиотеке Следеће генерације Апстрактан Напредак у секвенцирању нове генерације довео је до нових метода припреме библиотека компатибилних са више платформи за секвенцирање. Постојеће методе (и механичке и ензимске) суочавају се са ограничењима: протоколи у више корака, губитак узорка, недостатак аутоматизације и трошкови рада. Уз контину

Микробиологија: најбоље за ПЦР пристраности

Микробиологија: најбоље за ПЦР пристраности

Субјекти Метагеномицс Микробиом Технике засноване на ПЦР-у Многи фактори могу погрешити резултате широко коришћене технике појачања за анализу микробиома, али истраживачи проналазе стратегије за проналажење истине. Главни Замислите да држите бочицу воде која пузе микробима - и то је добра ствар, јер ви спроводите попис безбројних микроскопских становника језера из којих сте добили ту воду. Али ка

Мали дишни пут на чипу омогућава анализу упале плућа код људи и реакције на лекове ин витро

Мали дишни пут на чипу омогућава анализу упале плућа код људи и реакције на лекове ин витро

Субјекти Цитокини Лаб-он-а-цхип Дисање Транслационо истраживање Апстрактан Овде смо описали развој људског плућа „мали дишни пут на чипу“ који садржи диференцирани, мукоцилијарни бронхиоларни епител и темељни микроваскуларни ендотел који има проток течности, што омогућава анализу патофизиологије плућа на нивоу органа ин витро . Изложеност епитела интерлеукином-13 (ИЛ-13) реконструирала је хиперплазију пехарастих ћелија, хиперсекрецију цитокина и смањену цилијарну функцију астматичара. Мали чипи дишних путева обложени епителним ћелијама појединаца са хроничном опструктивном плућном болешћу рекап

Мера обновљивости

Мера обновљивости

Субјекти Биолошке технике Подаци истраживања Јасна идеја о перформансама - снаге, али и границе - биолошких метода истраживања је пресудна за генерисање поузданих података које други могу да репродукују. Способност понављања и надоградње на раду других научника или прилагођавање нечијих идеја када подаци сугерирају супротно, део је темеља који подржава научни процес. Али

Где су подаци?

Где су подаци?

Субјекти Издаваштво Натуре Метходс сада захтева да се изјаве о расположивости података испоруче са истраживачким радовима. Док истраживачка заједница прихвата размјену података, академски часописи могу дати свој дио помоћи. Од овог месеца, сви истраживачки радови прихваћени за објављивање у часопису Натуре , Натуре Метходс и 11 других Натуре наслова биће потребни да садрже информације о томе да ли и како читаоц

Означавање протеина протеина ин виво

Означавање протеина протеина ин виво

Субјекти Протеоме Протеомска анализа Протеомицс Алварез-Цастелао, Б. и др . Нат. Биотецхнол. 35 , 1196–1201 (2017). Методе за обележавање тек синтетизованих протеина омогућавају истраживачима да изваде протеине из ћелија ради идентификације коришћењем техника попут масне спектрометрије. Мутирани метионин-тРНА синтетаза (МетРС) омогућава да се метионин тРНА напуни с неприродним аналогним аминокиселинама азидонорлеуцин, који садржи биоортхогонални део који се може означити кликом хемијом помоћу ручице за пречиш

Исправљање: Упоредна визуализација односа генотипа и фенотипа

Исправљање: Упоредна визуализација односа генотипа и фенотипа

Оригинални чланак објављен је 30. јула 2015. године Нат. Методе 12 , 698–699 (2015); објављено на мрежи 30. јула 2015; исправљено након штампања 24. септембра 2015 У верзији овог чланка, првобитно објављеном, извор финансирања је изостављен. Аутори признају додатна средства од Медицинског вијећа за истраживање (програм МЦ_У142684171). Грешка је исправљена у ХТМЛ и ПДФ верзији чланка. Аутори Потражите

Складиштење ДНК и РНК у сувом стању, собна температура

Складиштење ДНК и РНК у сувом стању, собна температура

Апстрактан Вода скраћује рок трајања ДНК. Интегритет биосампа је упитан за узорке ускладиштене у влажном окружењу због постојаног ризика од хидролизе ДНК, чак и на ниској температури. ГенВаулт је развио пакет производа који укључује ГенПлатес ™, ГенСолве ™, ГенТегра ™ епрувете и ГенЦоннецт ™ за складиштење и управљање биосамповима сув

Масна спектрометрија: игра надокнађивања

Масна спектрометрија: игра надокнађивања

Масна спектрометрија је више него икад у првом плану функционалних протеомичких истраживања. Технологија је прешла дуг пут, али шта чека будућност? Натхан Блов добија перспективе, предвиђања и жеље кључних програмера. „Оно што смо видели у протеклој деценији углавном су била побољшања постојећих технологија, “ каже Франз Хилленкамп са Универзитета у Мунстеру. Јохн Иатес из истраживачког института

'Груби водич' за публикацију

'Груби водич' за публикацију

Предавање или поновно предавање рукописа - неки важни кораци и одлуке на том путу. Посетите метхагора да бисте видели и објавили коментаре на овај чланак. Пут до објављивања је за неке научнике добро пребијен, али другима изгледа више као мрачан, неозначен пут. Помаже да се зна шта можете очекивати од стручног прегледа (види нашу редакцију у мају 2006.), али такође и низ других процедуралних корака често изазива дезоријентацију. Ево неколико трагова и савета за путовања

Масна спектрометрија за биологе

Масна спектрометрија за биологе

Субјекти Спектрометрија масе Протеомицс Протеомска маса заснована на спектрометрији се и даље брзо шири, не само у погледу метода и инструмената, већ и биолошких питања. Царол Робинсон први пут је користила масни спектрометар као тинејџерка раних 1970-их. Сећа се високих напона, опасности и узбуђења. "Мо

Извори варијације

Извори варијације

Субјекти Подаци истраживања статистичке методе Апстрактан Да бисмо генерализовали закључке неке популације, морамо узорак њене варијације. Главни Променљивост је неизбежна у експериментима и због биолошких и техничких ефеката. Док техничку варијабилност треба строго контролирати да би се побољшала унутрашња валидност резултата, неке врсте биолошке варијабилности морају се одржавати како би се омогућила уопштавање резу

Хуманизовани фенотипски скрининг платформа за хронични бол

Хуманизовани фенотипски скрининг платформа за хронични бол

Субјекти Хронични бол Фенотипски скрининг Апстрактан Ценсо Биотецхнологиес и Целлецтрицон удружили су снаге како би развили платформу за хуманизовано откривање лекова прве врсте у циљу борбе са хроничном боли. Платформа је заснована на људским индукованим неуропирираним плурипотентним неуронским матичним ћелијама у комбинацији са Целлецтрицоновим системом за скрининг Целлакесс ® Електр

Структурна геномика у центру пажње

Структурна геномика у центру пажње

Напори структурне геномике покренули су континуирани развој нових метода и технологија, користи широкој заједници. Посетите метхагора да бисте видели и објавили коментаре на овај чланак. Једна од многих области истраживања која је започела почетак пројеката генома је област позната као структурна геномика, високопропусни подухват решавања тро

Грешка: имуноПЕТ за цело тело открива активну СИВ динамику у макакама третираним виремичним и антиретровирусним терапијама

Грешка: имуноПЕТ за цело тело открива активну СИВ динамику у макакама третираним виремичним и антиретровирусним терапијама

Оригинални чланак објављен је 09. марта 2015. године Нат. Методе 12 , 427–432 (2015); објављено на мрежи 9. марта 2015; исправљено након штампања 11. јуна 2015 У верзији овог чланка, првобитно објављеном, име Еммелине Л. Бланцхард погрешно је написано као Емелине. Грешка је исправљена у ХТМЛ и ПДФ верзији чланка. Аутори Потражите Пхилип Ј Сантангело у: Часописи

Академска провера иде са високом пропусношћу

Академска провера иде са високом пропусношћу

Субјекти Посао и индустрија Сцреенинг високе пропусности Научна заједница Стварање ефикасних екрана захтева време, скептицизам и проницљиве компромисе. Истраживачи у академским скрининг центрима стварају анализе за пројекте којих се велике фармацеутске компаније нерадо дотичу. Подстицај за скрининг центар на Универзитету Дундее, на пример, Шкотска, дошао је од научника који су открили обећавајуће циљеве лекова, али нису могли да заинтересовају комерцијалне партнере у програмима лечења паразитских инфекција у све

Објективно упоређивање метода праћења честица

Објективно упоређивање метода праћења честица

Субјекти Флуоресцентно снимање Обрађиванње слике Микроскопија Апстрактан Праћење честица је од кључног значаја за квантитативну анализу унутарћелијских динамичких процеса из података микроскопије са временским одмаком. Будући да ручно откривање и праћење великог броја појединачних честица није изведиво, многе групе су за те задатке развиле аутоматизоване рачунске методе. У циљу извођења објективне поређења

Дистрибуција узорковања и покретање система за покретање

Дистрибуција узорковања и покретање система за покретање

Субјекти Подаци истраживања Апстрактан Постројење за покретање може се користити за процену несигурности процена узорака. Главни Раније смо разговарали о важности процене несигурности у нашим мерењима и њеног укључивања у анализу података 1 . Да бисмо знали у којој мјери можемо генерализирати своја запажања, морамо знати како се наша процјена разликује у узорцима и је ли пристрана (систематски прецјењује или подцјењује истинску вриједност). На

Значи пишете новине

Значи пишете новине

Субјекти Издаваштво Писање јасног, тачног и убедљивог научног рада је и уметност и вештина. То је добро што савладате. У седамнаестом веку, рано у историји модерне експерименталне науке, открића су обично дистрибуирана унутар само одабране групе (С. Схапин, Социјална историја истине , Унив. Цхицаго Пресс; 1994). Научно предузеће данас је срећом демократскије и много веће. Без обзира на Твиттеру, научни радови су главно средство за комуникацију са дру

Студија узорка ХУПО теста открива уобичајене проблеме у протеомици заснованој на масној спектрометрији

Студија узорка ХУПО теста открива уобичајене проблеме у протеомици заснованој на масној спектрометрији

Исправљање овог чланка објављено је 01. јула 2009 Овај чланак је ажуриран Апстрактан Извели смо испитивање узорка теста како бисмо покушали да идентификујемо грешке које доводе до непробојности, укључујући непотпуност узорковања пептида, у течној хроматографији - протеомској базирању на масеној спектрометрији. Дистрибуирали смо еквимоларни тест узорак, који садржи 20 веома прочишћених рекомбинантних људских протеина, у 27 лабораторија. Сваки протеин садржи један или више јединствених триптографских пептида од 1.250 Да за тестирање селекције јона и узорковања у мас

Сцреенинг: старост риба

Сцреенинг: старост риба

Субјекти Имагинг Мицрофлуидицс Сцреенинг Зебрафисх Напредак микрофлуидике и снимања, у комбинацији са неким одмереним студијама, повећава интересовање за скрининг свих организама. Рандалл Петерсон није уписао факултетско планирање рада са зебрама. Уместо тога, он је желео да разуме како имуносупресивни лек рапамицин делује у интерак

Исправка: Искориштавање терцијарне структуре кроз локалне набора за кристалографско поступање

Исправка: Искориштавање терцијарне структуре кроз локалне набора за кристалографско поступање

Оригинални чланак објављен је 15. септембра 2013. године Нат. Методе 10 , 1099–1101 (2013); објављено на мрежи 15. септембра 2013; исправљено након штампања 5. маја 2014 У верзији овог чланка, првобитно објављеном, аутори нису признали све људе који су учествовали у генерисању скупа кристалографских података АФ1503 од А. фулгидус . Ове дифракционе податке су порекли М. Хулко, А. Урсинус, К. Бар, Ј. Мартин, КЗ и АН Лупас са Института Мак Планцк за развојну биологију, Тубинген. М. Хулко, А. Урсинус, К. Бар, Ј. Мартин и АН Лупас љубазно су дали п

АлпхаЛИСА имуноесеји: алтернатива ЕЛИСА-има без прања за истраживање и откривање лекова

АлпхаЛИСА имуноесеји: алтернатива ЕЛИСА-има без прања за истраживање и откривање лекова

Апстрактан ПеркинЕлмерови имунотести базирани на зрнцу АлпхаЛИСА ® дизајнирани су за детекцију аналита у биолошким узорцима. Ови хемилуминесцентни тестови без прања су идеални за минијатуризацију и аутоматизацију. Поседују изузетну осетљивост, широк динамички опсег и робусне перформансе које повољно упоређују са уобичајеним ензимски везаним имуносорбентом (ЕЛИСА). Главни ЕЛИСА је најчешће кориш

Протеински инжењеринг: навигација између шансе и разлога

Протеински инжењеринг: навигација између шансе и разлога

Субјекти Хемијске библиотеке Протеински инжењеринг Истраживачи користе велике библиотеке, фокусиране библиотеке и рационалан дизајн да би осмислили корисне протеине. Технологија протеина коришћена је за стварање лекова против антитела, веома светлих флуоресцентних протеина и ензима који смањују токсични отпа

Оптимизирана метода припреме библиотеке за секвенцирање нове генерације

Оптимизирана метода припреме библиотеке за секвенцирање нове генерације

Апстрактан Појава секвенцирања нове генерације омогућила је анализу генома на претходно недостижној дубини. Роцхе, Иллумина и Лифе Тецхнологиес су између осталог развили и добро основане платформе за дубоко секвенционирање. Без обзира на инструмент, једно од уских грла за следеће генерације је количина времена и ресурса потребних за припрему шаблона и библиотека. Овде смо описали технологију Нектера ™ компаније

Критичка процена тумачења метагенома - мерило софтвера за метагеномију

Критичка процена тумачења метагенома - мерило софтвера за метагеномију

Субјекти Класификација и таксономија Рачунарска биологија и биоинформатика Метагеномицс Апстрактан Методе састављања, таксономско профилирање и биннинг су кључне за интерпретацију података метагенома, али недостатак консензуса о бенчмаркингу комплицира оцјену перформанси. Изазов критичке процене интерпретације метагенома (ЦАМИ) ангажовао је глобалну заједницу програмера да успоставе своје програме на високо сложеним и реалистичним скуповима података, генерисаним од невли 700 ново секвенционисаних микроорга

Ерратум: Праћење структурне динамике протеина у раствору помоћу временски разрешеног ширококутног распршивања рендгенских зрака

Ерратум: Праћење структурне динамике протеина у раствору помоћу временски разрешеног ширококутног распршивања рендгенских зрака

Оригинални чланак објављен је 21. септембра 2008 Нат. Методи 5 , 881–886 (2008); објављено на мрежи 21. септембра 2008; исправљено након штампања 29. септембра 2008. У првобитно објављеној верзији овог чланка, временска скала која је наведена на слици 2д легенде је нетачна. Исправна временска скала треба да буде 3 µс. Поред тога, одлагање времена од 320 мс приказано на слици 5б је нетачно. Тачно одлагање времена је 200 мс. Ове грешке исправљене су у ХТМЛ и ПДФ

Матичне ћелије: модели болести који показују и говоре

Матичне ћелије: модели болести који показују и говоре

Субјекти Ћелијска култура Гене таргетинг Индуциране плурипотентне матичне ћелије Репортерски гени Научна заједница Матичне ћелије Апстрактан Комбиновање техника уређивања гена са индукованим плурипотентним матичним ћелијама је и моћно и тешко. Главни Ћелије су изгледале прелепо - и то је била лоша вест, сећа се Цливе Свендсен, истраживач матичних ћелија и неуробиолог из Медицинског центра Цедарс-Синаи. Развијао је ћелијски модел болести за спиналну ми

Усредсредите се на прављење мозга

Усредсредите се на прављење мозга

Субјекти Имагинг Неурознаност Визуализација функционалне повезаности у можданом кортексу човека заснована на подацима магнетне резонанце. Слика мозга Јоацхима Боттгера и Даниела Маргулиеса (Институт Мак Планцк за људске когнитивне и науке о мозгу, Лајпциг, Немачка) уз помоћ композиције Тобиаса С. Хоффманна. Композиција насловнице Ерин Девалт. Улазимо у нову еру у неурознаности у којој ће нам технолошки развој омогућити да добијемо потпуно анатомске приказе целих можданих кругова високе резолуције и да мапирамо активност све веће ћелијске попул

Масена спектрометрија за биологију кроматина

Масена спектрометрија за биологију кроматина

Субјекти Хроматин Хистонска анализа Спектрометрија масе Да би открили нове хистонске трагове и интеракције, истраживачи се окрећу софистицираним инструментима протеомике. Главни Намера истражитеља да провали један код може превидјети други. Тако смо у данима када се веровало да само ДНК секвенца чува све ћелијске тај

Слиједећи жице

Слиједећи жице

Ерратум на овај чланак објављен је 01. јануара 2008 Научници су можда коначно развили технике за реконструкцију комплетних дијаграма ожичења за неуронски круг људског мозга. Натхан Блов извјештава. 1880-их Сантиаго Рамон и Цајал почео је са испитивањем структуре људског мозга на ћелијском нивоу. Више од 100 годи

Научник и паметни телефон

Научник и паметни телефон

Субјекти Математика и рачунање Мобилне рачунарске платформе попут иПхонеа почињу да упадају у лабораторију - озбиљна перспектива или бајка? Посетите метхагора да бисте видели и објавили коментаре на овај чланак. Некада су се телефони користили искључиво за разговоре са другим људима, а рачунари су користили софтверске апликације. Рачунар је постао незаобилазно средство у лабораторији, д

Де ново састављање генома: шта би сваки биолог требао знати

Де ново састављање генома: шта би сваки биолог требао знати

Субјекти Биоинформатика Алгоритми за склапање генома Како се све више генома саставља од нуле, научници се боре да процене и побољшају њихов квалитет. Главни На питање колико је зрело поље састављања генома, Иан Корф са Калифорнијског универзитета у Давису то упоређује са тинејџером са великим способностима. „Има смеле тврдње о томе шта може учинити, али истовремено ствара срамотне грешке“, каже он. Можда је највећа препрека зрелости то што постоји неколико начина за разликовање истинског увида од безумних гафа. Кад се геном врсте ново састави, нико не зна шта ј

Исправљање: Упоредна анализа метода секвенцирања РНА за деградиране или слабе узорке

Исправљање: Упоредна анализа метода секвенцирања РНА за деградиране или слабе узорке

Субјекти РНА секвенцирање Трансцриптомицс Оригинални чланак објављен је 19. маја 2013. године Нат. Методе 10 , 623–629 (2013); објављено на мрежи 19. маја 2013; исправљено након 2. децембра 2013 У верзији овог чланка која је првобитно објављена, у одељку Онлине методе „Библиотеке РНасе Х“ реченица која почиње са „Додали смо 5 μл претходно загрејану РНасе Х ....“ требало је да гласи „Додали смо 5 μл претходно загрејану реакциону мешавину РНасе Х. који садржи 10 У хибридазне термостабилне РНазе Х (Епицентер), 0, 5 µмол Трис-ХЦл, пХ 7, 5, 1 µмол НаЦл и 0, 2 µмол МгЦл2 до смеше РНА и ДНК олиго, инк

Алат за неурознаност: увид у мозак

Алат за неурознаност: увид у мозак

Истраживачи у два неуростенска центра са седиштем у Бостону раде на развоју нових алата и технологија за обраду слике у нади да ће открити тајне начина функционисања мозга. Током недеље, неурознанственик са Универзитета Харвард Ранди Буцкнер путује неколико пута између своје две канцеларије у Бостону, једне у Март

Повлачење: Неочекиване мутације након уређивања ЦРИСПР-Цас9 ин виво

Повлачење: Неочекиване мутације након уређивања ЦРИСПР-Цас9 ин виво

Оригинални чланак објављен је 30. маја 2017. године Нат. Методе 14 , 547–548 (2017); објављено на мрежи 30. маја 2017; ажурирано на мрежи 14. јуна 2017; исправљено на мрежи 25. јула 2017; повучено 30. марта 2018 Овај рад се повлачи јер се геномске варијанте које су аутори приметили код два миша третирана ЦРИСПР-ом

Непараметријски тестови

Непараметријски тестови

Субјекти Подаци истраживања статистичке методе Исправљање овог чланка објављено је 27. јуна 2014 Овај чланак је ажуриран Непараметријски тестови робусно упоређују скениране или рангиране податке. Видели смо да је т -тест чврст у односу на претпоставке о нормалности и еквивалентности 1 , па је стога широко применљив. Постоји још једна класа метода - непара

Позивање следеће генерације реагенса за афинитет

Позивање следеће генерације реагенса за афинитет

Субјекти Генерација антитела Хемијска средства Живот у лабораторији Технологија Као надопуна антитела, нови реагенси за циљање протеина позивају широке врсте експеримената. Главни Да су само реагенси попут антитела били једноставни за стварање, стабилни дуги низ година, свестрани, обновљиви и јефтини и могли би научници

Упоређивање узорака - део И

Упоређивање узорака - део И

Субјекти Издаваштво Подаци истраживања статистичке методе Чврсто упоређивање парова независних или сродних узорака захтијева различите приступе т- тесту. Међу најчешћим врстама експеримената су упоредне студије које се разликују од исхода под различитим условима, као што су мушки према женском, плацебо насупрот леку или пре наспрам лечења. Анализа ових експеримената захтева методе за квантитативно упоређивање узорака како би се пресудило да ли разлике у подацима подржавају постојање ефекта у популацији коју представљају. Ова анализа је једноставна и робусна када се упоређују независни узорци; а

Кластерирање

Кластерирање

Субјекти Претрага података Обрада података Кластерирање проналази обрасце у подацима - били они тамо или не. Многе биолошке анализе укључују подјеле узорака или варијабли у кластере на основу сличности или обрнуто, удаљености. На пример, у студији генске експресије могли бисмо тражити подскупове пацијената са сличном експресијом или користити комплементарни приступ и идентификовати слично експримиране гене код па

СЕНСОЛУКС® самостална верзија: неинвазивно одређивање пХ и ДО у тиквицама

СЕНСОЛУКС® самостална верзија: неинвазивно одређивање пХ и ДО у тиквицама

Апстрактан Одређивање кинетичких параметара раста током раног развоја процеса је од пресудног значаја. Што се више информација добије, то се више могу користити стратегије за оптимизацију за генерисање високо продуктивних ћелијских линија. Нова СЕНСОЛУКС® технологија омогућава оптичко и неинвазивно мерење пХ и засићења раствореним кисеоником у тиквицама. Ова технологија омогућава једноставну методу детекције која је погодна за ефективно кр

Добар судија

Добар судија

Субјекти Биолошке технике Издаваштво Судије пружају непроцењиву услугу у унапређивању науке. Нудимо мало хране за размишљање о томе како ефикасно објавити радове о методама рецензије. Као судија, знате да судити о туђем послу није лако и треба много времена и пажње. Као аутор, вероватно сте видели да квалитет судијских извештаја може јак

Квантитативна сликовна цитометрија: инструментација избора за аутоматизовану ћелијску и ткивну анализу

Квантитативна сликовна цитометрија: инструментација избора за аутоматизовану ћелијску и ткивну анализу

Субјекти Ћелијско снимање Проточна цитометрија Апстрактан Ласерска скенирајућа цитометрија (ЛСЦ) је технологија избора за аутоматизирану, квантитативну анализу високог протока са високим протоком хетерогених ћелијских узорака и узорака ткива. ЛСЦ допуњава проточну цитометрију омогућавајући анализу узорака везаних за чврсте подлоге, као што су адхезивне ћелије и узорци ткива. Такође повећава конфокалне системе за обраду слике, што олакшава анализу п